Der Polizeiseelsorge Südbayern sind die Präsidien München, Oberbayern Süd, Oberbayern Nord, Schwaben Nord, Schwaben Süd-West und Niederbayern zugeordnet.

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Darüber hinaus sind die Bereitschaftspolizeiabteilungen I. Abt. München, II. Abt. Eichstätt, V. Abt. Königsbrunn und VI. Abt. Dachau zugeordnet.